曹操后裔分布点
　　争论一：古代骸骨能否进行DNA检测

　　复旦大学检测的Y染色体DNA，属于核DNA。北京华大方瑞司法物证鉴定中心主任邓亚军说，虽然核DNA用第二代测序仪可以测出来，但需要后期拼接。没有高超的信息分析水平和生物信息的拼接能力，即使提取出来也无法进行拼接。
　　“对古代陈旧的DNA进行检测，越古老难度越大。”邓亚军说，“检测古DNA最重要的一步是清除污染，排除骸骨微生物的侵蚀和外在留存的DNA。”
　　“DNA验证曹操遗骨”课题组负责人之一、复旦生命科学学院副教授李辉则回应称：“我目前还没有看过骸骨实物，通过图片显示，我认为我们实验室有足够的能力提取这些骸骨的DNA。”
　　李辉表示，只需取骸骨中的一颗牙，在牙上切一个横断面，提取其中物质便可得到相关信息，之后也不会对牙齿的拼接复原造成影响。
　　争论二：靠族谱觅曹操后裔可靠吗

　　邓亚军质疑说：“能保证曹操代代谱系都有男孩吗？历史上的断代、入赘、赐姓，包括有人说的曹家被灭门，都会对曹氏谱系造成较大影响，曹氏家族的Y染色体也可能受到影响。”因而靠家谱征集来的所谓后人中肯定会出现不同种类的Y染色体。
　　李辉承认族谱中肯定存在错误，但他认为对整体研究成果不会造成影响，而且是曹姓发展演变的最好参照。“一个村子的人都姓曹，其中有一个是改姓曹的，也不会对整体基因造成影响。”
　　争论三：如何确定不是同姓亲戚

　　邓亚军强调，单靠检测后代的Y染色体，只能确定其是曹操家族，但不能确认是曹操本人的后人。他说：“理论上即使所有问题解决，提取了后人确定的DNA，也提取了古DNA进行比对，结果即使很像，也只能证明存在共同的父系遗传关系。”
　　李辉没有正面回答这一问题。他表示只能等结果出来才能确定。 “复旦课题组能做的是提取曹操后人的DNA。最后能不能确定是曹操本人的墓，通过什么途径确定，要等样本分析出来再去谈。” 孟津